Dbając o wysoki poziom usług prowadzimy systematyczną wewnątrzlaboratoryjną i zewnątrzlaboratoryjną kontrolę jakości. Od 1999 roku Laboratorium Mikrobiologiczne bierze udział w Ogólnopolskim Sprawdzianie Wiarygodności Badań w Mikrobiologii przeprowadzanym przez Centralny Ośrodek Badań Jakości w Diagnostyce Mikrobiologicznej . Co roku Laboratorium Mikrobiologiczne uzyskuje bardzo dobre wyniki oraz certyfikat.